W latach 1973-80 do polskiego lotnictwa wojskowego trafiło 18 maszyn typu Jak-40. Na wyposażeniu Polskich Sił Powietrznych pozostawały do 2011 r.

Podczas lotu samolotu prezydenckiego 10.04.2010 r. samolot Jak-40 nr 044 był wyznaczony jako samolot rezerwowy dla TU-154. Po awarii Jaka-40 o numerze bocznym 047, którym mieli lecieć dziennikarze i dowódcy wojskowi, samolot ten poleciał z dziennikarzami do Smoleńska. Był on ostatnim samolotem jaki wylądował na lotnisku w Smoleńsku przed katastrofą prezydenckiego Tu-154 w dniu 10.04.2010. Wycofany został ze służby w 36 Specjalnym Pułku Transportowym w dniu 4.08.2011 r.