Od 25 lipca 2012 r. można zwiedzać wnętrze samolotu pasażerskiego Jak–40. Jest to jeden z ostatnich nabytków MWP, przekazany do Muzeum po likwidacji 36. Specjalnego Pułku Lotnictwa Transportowego. Samolot o numerze bocznym 044 służył do transportu najważniejszych osób w państwie. Samolot można zwiedzać: w środy, czwartki, soboty i niedziele w godzinach 11.00-16.00. Cena biletu 2 zł.
W latach 1973-80 do polskiego lotnictwa wojskowego trafiło 18 maszyn typu Jak-40. Na wyposażeniu Polskich Sił Powietrznych pozostawały do 2011 r.
Podczas lotu samolotu prezydenckiego 10.04.2010 r. samolot Jak-40 nr 044 był wyznaczony jako samolot rezerwowy dla TU-154. Po awarii Jaka-40 o numerze bocznym 047, którym mieli lecieć dziennikarze i dowódcy wojskowi, samolot ten poleciał z dziennikarzami do Smoleńska. Był on ostatnim samolotem jaki wylądował na lotnisku w Smoleńsku przed katastrofą prezydenckiego Tu-154 w dniu 10.04.2010. Wycofany został ze służby w 36 Specjalnym Pułku Transportowym w dniu 4.08.2011 r.